故事的舞台是互(📯)联网系统发达(😖)的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技(👚)术社」(🍟)通过高度的(📐)网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都(🅱)在那(🏿)个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现(🛍)了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目(😦)标是将存在于互联网(🅾)的某处的“AI们的世(🍬)界=电子界”毁(🐜)灭。然而在世界受到这样的(➿)威胁时，有一名(👋)决斗者(😴)站(🎍)了(🌨)出(🌴)来。而他的名(📪)字正(👲)是「Playmaker」(🦆)。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海(⏺)诺因(🎦)骑士(🍓)团(📤)」打倒，成功捕(🉐)获了「(🌱)SOL技术社」和「海诺(😣)因骑(🕣)士团」都想要得手的(🐫)迷之AI程序。一度拯救了世界，然(🕳)后却突然消声匿迹了，而他的(🤼)名字(🐧)就在互联(⏰)网的世界中一(🤽)瞬间变得声名远(😆)播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正(〰)体的某(🌚)位高中生(🌥)藤木游作，为了寻找过去(🕕)发生的某件事件的真相，对再次在(🥫)「(💵)VRAINS」出现(🔗)的(🔆)「海诺因骑士团」(🎍)展开了追击......  以此为契机(💾)，命(😹)运(🔰)的齿轮就此转动……迷(🥪)之(📒)AI的真身，「海(🏠)诺因骑士团」(😴)盯上「Link Vrains」(🍖)的目(🎃)的，以及隐藏在游作过(😣)去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中(🤝)